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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
五年间 “江豚微笑”“万鸟齐翔”成为美丽江西生动名片******
中新网南昌1月12日电 (袁汝晶)绿色发展指数连续9年居中部地区第1位、全省森林覆盖率稳定在63.1%以上、长江干流江西段连续5年、赣江干流连续2年达到Ⅱ类水质……
12日下午，江西省十四届人大一次会议举行第二次全体会议。江西省发展和改革委员会主任张和平就国家生态文明试验区(江西)建设情况作报告时指出，五年来，赣鄱大地天更蓝、山更绿、水更清，“江豚微笑”“万鸟齐翔”成为美丽江西生动名片。
1月12日下午，江西省发展和改革委员会主任张和平作关于国家生态文明试验区(江西)建设情况的报告。 刘占昆 摄张和平称，过去五年，国家生态文明试验区建设迈上新台阶，打造美丽中国“江西样板”取得显著成效。全面建立省市县三级党政主要领导为组长的生态文明建设推进体系，在全国首创省人民政府向省人代会报告生态文明建设情况制度；生态产品价值实现机制、多元化生态保护补偿、山水林田湖草沙综合治理、生态司法、绿色金融创新等特色改革在全国形成样板。
“过去一年，长江经济带披露62个问题完成整改60个，完成尾矿库闭库122座；完成人工造林101.2万亩，江西省自然保护区达到190个；全国唯一部省共建江豚保护基地落户江西，长江江豚出现频次大幅度增加。”张和平表示，2022年江西推进长江经济带“共抓大保护”，持续打好蓝天、碧水、净土保卫战。
针对未来重点工作，张和平称，江西将持续深化国家生态文明试验区建设，积极稳妥推进碳达峰碳中和，深入推进环境污染防治，不断提升生态系统质量；加快推动生态产品价值实现，协同推进降碳、减污、扩绿、增长，扎实做好治山理水、显山露水文章，努力构建美丽中国建设样板区、生态文明改革引领区、全面绿色转型先行区、生态福祉共享示范区。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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